西瓜为虫媒花，在正常的条件下靠昆虫传粉，但在早熟品种或保护地栽培时，由于气温低等原因，昆虫数量少或限制了昆虫传粉。在多雨地区，开花座果期正处于多雨季节，西瓜常会因授粉受精不良座果率不高，空蔓率增加。为提高无籽西瓜座果率，提高单产，增加总产，须进行人工辅助授粉。瓜农可选择西瓜第2朵和第3朵雌花授粉，能有效提高座果率，确保产量高、品质优。人工辅助授粉要注意如下几点：
1.掌握好时间 西瓜的雌雄都为半日花，清晨开放，午后闭花，授粉应掌握在花开放时进行。刚开放的雄花花药内花粉充足活力强，且此时的温湿度适宜西瓜授粉受精，故早晨是授粉的黄金时间。雌花在清晨开花2小时之内柱头的生理活动最旺盛，故在此时授粉、受精座果率最高。如温度高，授粉时间过迟，雄花花粉易脱落，且花粉易干燥，生命力弱，影响授精。
2.操作要灵巧 西瓜开花座果期，晴天早晨7时 ～9时、阴天上午8时～10时摘取当日开花的雄花，将花药在雌花的柱头上轻轻涂抹即可。涂抹要均匀、周到，用力不要过猛，以免碰伤柱头和子房。1朵雄花可供1朵～2朵雌花授粉。若1朵雄花授多朵雌花，则授粉量不够，结的瓜很可能畸形，品质低劣。只有授足花粉，果实才端正、品质好。
3.下雨罩纸罩 据观察，西瓜从授粉至受精大致需1天时间。在正常气候条件下，早晨7时～9时，柱头稍带绿色，并分泌少量粘液，授粉后经15分钟～20分钟花粉开始萌发，2小时后花粉管伸入柱头，5小时左右伸至柱头中部分歧处，再经5小时可达花柱基部，24时左右即可达到胚珠，完成受精。
阴雨天气，活动昆虫数量减少，同时由于降雨造成花粉流失，不能进行授粉。雨天的花粉粒易吸水胀破，失去发芽力。据有关研究报道，授粉后90分钟内降水，雌花也不能受精结实，只有10%的结实率。授粉后180分钟内降水1小时以上，结实率也达不到56%。授粉前降水，只要柱头保持干燥，并授以正常的花粉，对受精和结果的影响不大。所以人工授粉后，3小时之内遇到降雨，需进行人工补充授粉1次。如果天气不好，又正值授粉期，必须强制座瓜。在授粉时，做好纸罩，将授了粉的雌花用纸罩罩好，经过12小时或到第2天取纸罩，避免雨水浸湿柱头，使花粉吻合好，座果率高.